Nuestra biblioteca colonial dispone de aproximadamente 2.000 obras impresas producidas entre los siglos XVI y XVIII.  Es la biblioteca más importante de libros coloniales de la Compañía de Jesús en Bolivia.  Consta de libros de las más diversas materias, como ser teología, Sagradas Escrituras, historia eclesiástica,  derecho canónico, derecho civil, homilética, pastoral y catequética,  literatura, historia y hagiografía, impresos en las más grandes tipografías europeas.

Su origen e historia se remonta a las bibliotecas de las distintas residencias de la compañía de Jesús en Bolivia.

Con la expulsión de los jesuitas, la biblioteca ha pasado primero a manos de la Orden de San Francisco de Asis y después a las bibliotecas de la Honorable Alcaldía Municipal de Cochabamba para finalmente ser reestablecida como biblioteca de la Compañía por el Padre Estanislao Just, s.j.